Воздействия лекарственных средств на геном, транскриптом, протеом и метаболом изучаются постгеномной фармакологией. Большинство лекарств, как правило, воздействуют на активность тех или иных белков протеома, что, в свою очередь, оказывает воздействие на метаболом и состояние генома. Однако, при комплексной оценке эффектов лекарств в парадигме постгеномной медицины не менее важно оценить воздействия лекарства генную экспрессию (т.е. на уровни различных мРНК транскриптома).
Транскриптомные исследования лекарств in vitro весьма требуют комплекса специального оборудования для анализа экспрессии генов с помощью ДНК-микрочипов, крайней аккуратности в выборе анализируемых клеточных культур, обработке получаемых данных и, поэтому, весьма дорогостоящи (10000…20000 евро на транскриптомное исследование 1-ой молекулы) и практически недоступны и в России, и за рубежом.
В то же время, в базе данных GEO (Gene Expression Omnibus, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) накоплены результаты более чем 160,000 транскрипмтомных исследований (более 50,000 терабайт данных). С использованием новейших методов искуственного интеллекта для анализа «сверхбольших данных» (big data) в Институте фармакоинфоматики разработан метод хемотранскриптомного анализа эффектов молекул (прогнозирования эффектов молекул-лигандов на генную экспрессию, т.е. на транскриптом человека).