В современной фармацевтике препараты рассматриваются как имеющие некое «основное» действие (как правило, достаточно простое – ингибирование того или иного белка, модуляция активности тех или иных групп генов и др.) и «побочные» эффекты (положительные или отрицательные). Обычно, выведение на рынок препарата ограничивается только стандартными тестами (включая тесты по специфической фармакологической активности) и большинство эффектов препарата (в частности, сравнение с эффектами других препаратов) остаются неизученными.
Хемореактомный анализ молекул, проводимый на основе современных методов интеллектуального анализа данных и машинного обучения, предоставляет уникальную возможность сравнительного исследования эффектов различных молекул на реактом – совокупность всех химических реакций в организме и, вежде всего, провести оценки возможных взаимодействий с различными видами таргетных белков. В основе хемоинформационного подхода – сравнение химической структуры молекулы с сотнями тысяч других молекул, для которых были изучены молекулярно-фармакологические свойства.